巣枠に巣を作ってくれず、台の臼に作ってしまいました

古い臼がありましたので下をくり抜いて、臼の上に2段の巣枠を置いて下の巣門から臼の内部を通って、上の巣枠に蜜を貯めてもらうつもりでしたが臼内に巣を作ってしまいました。これでは蜜も取りずらいし、なぜ巣枠に巣を作らなかったのか分かる方教えて下さい。又、最近蜂が極端に少なくなってしまいました　以前は巣枠の上から覗くと巣が見えない位の大群がいましたが今は10匹位しか見えません　下痢？らしい糞が少し臼の外側についていますがアカリンダニのせいか？女王バチがいなくなったか分かりません　蜜はかなり残っている様ですが　暫くこのまま様子を見た方が良いですか。